Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYT9Q86SS6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms