Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LRIG3Q6UXM1 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LRIG3Q6UXM1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms