Protein–RNA interactions for Protein: Q32MK0

MYLK3, Myosin light chain kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYLK3Q32MK0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MYLK3Q32MK0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms