Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TAF11Q15544 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TAF11Q15544 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms