Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PUM3Q15397 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms