Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 GCDH-212ENST00000590530 1871 ntTSL 219.18■□□□□ 0.667e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-208ENST00000489117 770 ntTSL 318.79■□□□□ 0.67e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.67e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DNAJC19-207ENST00000485675 1630 ntTSL 218.78■□□□□ 0.64e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.597e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SACS-203ENST00000423156 1709 ntTSL 218.63■□□□□ 0.577e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DNAJC19-203ENST00000472504 819 ntTSL 218.59■□□□□ 0.574e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.577e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.567e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.567e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.557e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RAB4B-202ENST00000378307 890 ntTSL 1 (best)18.45■□□□□ 0.547e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.547e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WDR54-205ENST00000465134 1862 ntTSL 1 (best)18.41■□□□□ 0.547e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DNAJC19-206ENST00000482363 1133 ntTSL 218.3■□□□□ 0.524e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.527e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AC011530.1-203ENST00000597712 432 ntTSL 218.27■□□□□ 0.524e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.517e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MKNK2-207ENST00000588014 2413 ntTSL 218.25■□□□□ 0.511e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.57e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BRMS1-205ENST00000527375 913 ntTSL 318.17■□□□□ 0.57e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.57e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.57e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SART1-208ENST00000533386 586 ntTSL 218.1■□□□□ 0.495e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.487e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.477e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-212ENST00000563038 2692 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.477e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BRMS1-208ENST00000530756 963 ntTSL 1 (best)17.99■□□□□ 0.477e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.467e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.457e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.437e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WDR54-210ENST00000480089 1046 ntTSL 517.62■□□□□ 0.417e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAPD5-204ENST00000562717 1866 ntTSL 517.61■□□□□ 0.417e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BRMS1-204ENST00000525127 750 ntTSL 217.6■□□□□ 0.417e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.47e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GTPBP1-210ENST00000484971 582 ntTSL 317.46■□□□□ 0.391e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GTPBP1-203ENST00000458073 1350 ntTSL 517.1■□□□□ 0.331e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ACOT8-210ENST00000487205 702 ntTSL 317.09■□□□□ 0.334e-7■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BRMS1-209ENST00000534617 905 ntTSL 216.91■□□□□ 0.37e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-218ENST00000566982 3024 ntTSL 216.87■□□□□ 0.297e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.297e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.277e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.277e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.277e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AC011530.1-202ENST00000596586 397 ntAPPRIS P5 TSL 216.69■□□□□ 0.264e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AC011530.1-204ENST00000595946 321 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.69■□□□□ 0.264e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ARPC1A-204ENST00000471960 741 ntTSL 316.69■□□□□ 0.267e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.247e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.227e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 DMWD-203ENST00000537879 843 ntTSL 1 (best)16.3■□□□□ 0.27e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PHF5A-203ENST00000491254 292 ntTSL 316.21■□□□□ 0.197e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.187e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.167e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RAB4B-EGLN2-202ENST00000596216 624 ntTSL 316.04■□□□□ 0.167e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 RAB4B-204ENST00000597476 1982 ntTSL 216.04■□□□□ 0.167e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.137e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZMIZ2-210ENST00000478045 3549 ntTSL 1 (best)15.78■□□□□ 0.127e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZMIZ2-208ENST00000463056 3240 ntTSL 215.56■□□□□ 0.087e-6■■□□□ 14.2
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PABPC4Q13310 FAH-210ENST00000559542 782 ntTSL 315.36■□□□□ 0.057e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.047e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.037e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC15.23■□□□□ 0.037e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.027e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CA5BP1-202ENST00000380333 926 ntTSL 215.14■□□□□ 0.017e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WDR54-206ENST00000468778 2356 ntTSL 215.11■□□□□ 0.017e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.027e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-209ENST00000473499 634 ntTSL 214.88□□□□□ -0.037e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GCDH-207ENST00000588242 1006 ntTSL 214.86□□□□□ -0.037e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MRPS33-205ENST00000472343 788 ntTSL 214.73□□□□□ -0.057e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 214.65□□□□□ -0.067e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.077e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TOP3A-206ENST00000489131 582 ntTSL 314.61□□□□□ -0.071e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 APOPT1-205ENST00000474271 540 ntTSL 414.5□□□□□ -0.097e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 214.5□□□□□ -0.097e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.097e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.097e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 KLHL23-202ENST00000392647 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.17e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GLIPR2-202ENST00000377960 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.117e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRB10-202ENST00000357271 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.127e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.127e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAAF1-214ENST00000544552 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.147e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EPHB6-203ENST00000471581 475 ntTSL 214.02□□□□□ -0.177e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GLIPR2-201ENST00000377959 812 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.27e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.27e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PAAF1-215ENST00000544909 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 TMEM147-AS1-205ENST00000590717 3300 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.247e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 PDCD11-204ENST00000478543 717 ntTSL 213.46□□□□□ -0.251e-10■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 213.38□□□□□ -0.277e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CA5BP1-203ENST00000380334 1264 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.277e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ARPC1A-203ENST00000463009 719 ntTSL 312.87□□□□□ -0.357e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 CA5B-210ENST00000498004 488 ntTSL 312.85□□□□□ -0.357e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 EIF2A-214ENST00000487799 1913 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.367e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 WDR54-207ENST00000469321 864 ntTSL 512.76□□□□□ -0.377e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 ZMIZ2-201ENST00000265346 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.417e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 SACS-204ENST00000455470 2784 ntTSL 1 (best)12.36□□□□□ -0.437e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 LINC00623-202ENST00000614062 830 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.457e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 GRB10-210ENST00000407526 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.457e-6■■□□□ 14.2
PABPC4Q13310 MPRIP-205ENST00000395811 10960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.457e-6■■□□□ 14.2
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