Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CGNL1Q0VF96 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms