Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HSF1Q00613 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms