Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
UBASH3AP57075 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms