Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HLA-DMAP28067 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms