Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OPN1SWP03999 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OPN1SWP03999 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms