Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RAPGEF3O95398 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RAPGEF3O95398 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
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