Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV9

TRAK1, Trafficking kinesin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK1Q9UPV9 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TRAK1Q9UPV9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRAK1Q9UPV9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms