Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWH2

FUNDC2, FUN14 domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FUNDC2Q9BWH2 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
FUNDC2Q9BWH2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms