Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
HJURPQ8NCD3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HJURPQ8NCD3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms