Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ZNF550Q7Z398 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms