Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TDRD12Q587J7 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms