Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TTLL9Q3SXZ7 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms