Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TOP3AQ13472 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TOP3AQ13472 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TOP3AQ13472 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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