Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC3A1Q07837 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SLC3A1Q07837 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms