Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TFF3Q07654 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms