Protein–RNA interactions for Protein: P55055

NR1H2, Oxysterols receptor LXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H2P55055 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NR1H2P55055 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms