Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
UBXN7O94888 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
UBXN7O94888 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms