Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 SEC62-201ENST00000337002 6568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.295e-6■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 SEC62-208ENST00000481435 627 ntTSL 26.31□□□□□ -1.45e-6■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 SEC62-204ENST00000469515 785 ntTSL 36.12□□□□□ -1.435e-6■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 SEC62-202ENST00000460513 641 ntTSL 54.46□□□□□ -1.75e-6■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 SEC62-209ENST00000487736 508 ntTSL 53□□□□□ -1.935e-6■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 SCAF8-205ENST00000464628 468 ntTSL 510.64□□□□□ -0.712e-6■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 TUBGCP6-202ENST00000425018 1509 ntTSL 1 (best)20.45■□□□□ 0.861e-10■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 TUBGCP6-207ENST00000491449 4044 ntTSL 512.61□□□□□ -0.391e-10■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.281e-14■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 PTPRS-201ENST00000262963 4766 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.41e-14■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 PTPRS-210ENST00000592099 4766 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.41e-14■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 CROCCP2-204ENST00000639456 2575 ntTSL 518.78■□□□□ 0.66e-7■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.12■□□□□ 0.496e-7■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 MYH9-201ENST00000216181 7501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 BCL2L2-205ENST00000557236 631 ntTSL 518.86■□□□□ 0.614e-7■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.675e-8■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.585e-8■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 ARID1A-216ENST00000637465 699 ntTSL 54.59□□□□□ -1.675e-8■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 TRIO-214ENST00000509967 4949 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.893e-6■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 PLXNB1-209ENST00000466353 626 ntTSL 317.74■□□□□ 0.433e-7■■□□□ 12.5
PRPF4O43172 PLCB1-227ENST00000636825 3020 ntTSL 58.19□□□□□ -1.11e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PLCB1-221ENST00000635830 3237 ntTSL 57.72□□□□□ -1.171e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NFATC2IP-202ENST00000562977 638 ntTSL 425.05■■□□□ 1.67e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.717e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NFATC2IP-203ENST00000564978 2350 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.867e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.893e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 BZW1-208ENST00000452206 1059 ntTSL 512.74□□□□□ -0.373e-7■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.113e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 BZW1-207ENST00000450637 578 ntTSL 47□□□□□ -1.293e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 BZW1-210ENST00000460660 265 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.323e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RHBG-209ENST00000622297 720 ntTSL 513.11□□□□□ -0.312e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.164e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GABPB1-203ENST00000380877 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.414e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GABPB1-208ENST00000558970 730 ntTSL 511.92□□□□□ -0.54e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GABPB1-206ENST00000543881 1450 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.614e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GABPB1-210ENST00000560825 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.734e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GABPB1-205ENST00000429662 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.944e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.584e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.673e-9■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.563e-9■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 415.6■□□□□ 0.092e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.14■□□□□ 0.653e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 NT5DC2-213ENST00000489316 772 ntTSL 515.15■□□□□ 0.021e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.46e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GAPDH-209ENST00000492719 930 ntTSL 312.69□□□□□ -0.386e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GAPDH-208ENST00000474249 1333 ntTSL 512.53□□□□□ -0.46e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.456e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 GAPDH-202ENST00000396856 1266 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.566e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.83e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 COMMD7-204ENST00000610160 1987 ntTSL 222.93■■□□□ 1.263e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.593e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 COMMD7-203ENST00000474815 488 ntTSL 515.82■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 TARDBP-230ENST00000639083 2269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-14■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 TARDBP-221ENST00000619555 682 ntTSL 510.58□□□□□ -0.722e-14■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 TARDBP-218ENST00000617172 980 ntTSL 59.25□□□□□ -0.932e-14■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 TARDBP-227ENST00000622057 706 ntTSL 58.86□□□□□ -0.992e-14■■□□□ 12.4
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PRPF4O43172 TARDBP-216ENST00000614494 515 ntTSL 57□□□□□ -1.292e-14■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 AL109811.4-202ENST00000611136 700 ntTSL 54.12□□□□□ -1.752e-14■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 AL109811.4-203ENST00000612542 554 ntAPPRIS P1 TSL 53.63□□□□□ -1.832e-14■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 TARDBP-208ENST00000477447 409 ntTSL 53.63□□□□□ -1.832e-14■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PEX26-204ENST00000474897 2082 ntTSL 519.14■□□□□ 0.654e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.044e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 QTRT1-207ENST00000589488 1571 ntTSL 521.4■■□□□ 1.021e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.691e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 QTRT1-202ENST00000421333 1502 ntTSL 217.28■□□□□ 0.361e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 QTRT1-206ENST00000587861 2034 ntTSL 217.08■□□□□ 0.321e-10■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 MIR4713HG-201ENST00000559909 561 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.61e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 ACSS2-208ENST00000473172 665 ntTSL 318.68■□□□□ 0.588e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.974e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 KRTAP5-AS1-202ENST00000524947 570 ntTSL 418.79■□□□□ 0.64e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 KRTAP5-AS1-204ENST00000534077 409 ntTSL 317.64■□□□□ 0.414e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 KRTAP5-AS1-203ENST00000532922 519 ntTSL 412.93□□□□□ -0.344e-7■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-207ENST00000595811 572 ntTSL 520.97■□□□□ 0.955e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.925e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-209ENST00000596837 682 ntTSL 220.7■□□□□ 0.95e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.775e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-203ENST00000594017 959 ntTSL 219.52■□□□□ 0.725e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-202ENST00000593570 813 ntTSL 519.4■□□□□ 0.75e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-208ENST00000596247 1563 ntTSL 219.3■□□□□ 0.685e-6■■□□□ 12.4
PRPF4O43172 RUVBL2-201ENST00000221413 1478 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.265e-6■■□□□ 12.4
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