Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
J3QRK9 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
J3QRK9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
J3QRK9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms