Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUJ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUJ7 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
A0A087WUJ7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms