Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N5

SQOR, Sulfide:quinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQORQ9Y6N5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQORQ9Y6N5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQORQ9Y6N5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQORQ9Y6N5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQORQ9Y6N5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQORQ9Y6N5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQORQ9Y6N5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SQORQ9Y6N5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SQORQ9Y6N5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SQORQ9Y6N5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SQORQ9Y6N5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms