Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W9

SNX11, Sorting nexin-11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11Q9Y5W9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SNX11Q9Y5W9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SNX11Q9Y5W9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SNX11Q9Y5W9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SNX11Q9Y5W9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms