Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4U1

MMACHC, Methylmalonic aciduria and homocystinuria type C protein, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMACHCQ9Y4U1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MMACHCQ9Y4U1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MMACHCQ9Y4U1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MMACHCQ9Y4U1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMACHCQ9Y4U1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMACHCQ9Y4U1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMACHCQ9Y4U1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MMACHCQ9Y4U1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMACHCQ9Y4U1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMACHCQ9Y4U1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MMACHCQ9Y4U1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms