Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4R7

TTLL3, Tubulin monoglycylase TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3Q9Y4R7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TTLL3Q9Y4R7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TTLL3Q9Y4R7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTLL3Q9Y4R7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTLL3Q9Y4R7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms