Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
KNSTRNQ9Y448 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.15■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
KNSTRNQ9Y448 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
KNSTRNQ9Y448 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
KNSTRNQ9Y448 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KNSTRNQ9Y448 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms