Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
TPRKBQ9Y3C4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TPRKBQ9Y3C4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TPRKBQ9Y3C4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms