Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERVW-1Q9UQF0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERVW-1Q9UQF0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ERVW-1Q9UQF0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms