Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQC9

CLCA2, Calcium-activated chloride channel regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA2Q9UQC9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLCA2Q9UQC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
CLCA2Q9UQC9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CLCA2Q9UQC9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CLCA2Q9UQC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CLCA2Q9UQC9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms