Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCML1Q9UN30 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCML1Q9UN30 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCML1Q9UN30 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCML1Q9UN30 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms