Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPRQQ9UMZ3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
PTPRQQ9UMZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPRQQ9UMZ3 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPRQQ9UMZ3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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