Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.82■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.49
MLH3Q9UHC1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC36.82■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.82■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.8■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.78■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
MLH3Q9UHC1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
MLH3Q9UHC1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
MLH3Q9UHC1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC36.61■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
MLH3Q9UHC1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms