Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH73

EBF1, Transcription factor COE1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF1Q9UH73 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EBF1Q9UH73 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EBF1Q9UH73 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EBF1Q9UH73 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 714.2 ms