Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG3Q9UGV2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG3Q9UGV2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG3Q9UGV2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDRG3Q9UGV2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG3Q9UGV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG3Q9UGV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDRG3Q9UGV2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NDRG3Q9UGV2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NDRG3Q9UGV2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NDRG3Q9UGV2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms