Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NXF1Q9UBU9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NXF1Q9UBU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NXF1Q9UBU9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NXF1Q9UBU9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms