Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NLKQ9UBE8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NLKQ9UBE8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NLKQ9UBE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms