Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X8

LINC00474, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00474, humanhuman

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00474Q9P2X8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00474Q9P2X8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00474Q9P2X8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00474Q9P2X8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms