Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL9Q9P2J3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLHL9Q9P2J3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL9Q9P2J3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms