Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
RRBP1Q9P2E9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.98■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
RRBP1Q9P2E9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
RRBP1Q9P2E9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC36.82■■■■□ 3.49
RRBP1Q9P2E9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RRBP1Q9P2E9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms