Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1A2

PPP4R1L, Putative serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R1LQ9P1A2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R1LQ9P1A2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R1LQ9P1A2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP4R1LQ9P1A2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms