Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY59

SMPD3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD3Q9NY59 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SMPD3Q9NY59 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SMPD3Q9NY59 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SMPD3Q9NY59 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms