Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJC28Q9NX36 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
DNAJC28Q9NX36 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DNAJC28Q9NX36 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms