Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IMP3Q9NV31 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IMP3Q9NV31 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IMP3Q9NV31 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IMP3Q9NV31 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms