Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EMILIN3Q9NT22 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EMILIN3Q9NT22 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
EMILIN3Q9NT22 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EMILIN3Q9NT22 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms