Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CENPMQ9NSP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPMQ9NSP4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CENPMQ9NSP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CENPMQ9NSP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms